Создана база данных MoDEL - самая большая в мире база белков и протеинов.

База MoDEL


Новая база данных, разработанная испанскими учеными-биологами, была помещена в открытый доступ. Теперь услугами этой базы могут воспользоваться все желающие, а основными ее пользователями станут ученые-фармацевты и биологи, разрабатывающие новые лекарственные препараты и методики лечения заболеваний. Эта база, имеющая название MoDEL, содержит данные о движениях более чем 1700 видов белковых молекул, входящих в состав человеческого организма, что делает ее самой крупной в мире базой данных в этой области.

База данных MoDEL была разработана на основе данных, полученных посредством интенсивных вычислений суперкомпьютера, находящегося в центре Barcelona Supercomputing Center. Используя эти данные и данные из международной базы данных Protein Data Bank (PDB) ученые создали новую базу, на этот раз базу не просто структуры белков, а видеоинформации, демонстрирующей движение белковых молекул. Каждый из 1700 видов белков, представленных в базе, демонстрируется, используя последовательность из 10000-100000 снимков, демонстрирующих движения и превращения сложной структуры белковых молекул. Конечно, 1700 из 40000 видов белков человеческого организма это не так уж и много, но и эта цифра представляет собой уже 40% от общего количества известных ученым белков с изученной структурой.

Так чем же примечательно создание такой базы? Благодаря собранным данным ученые-фармацевты смогут начать разрабатывать новые виды лекарственных препаратов, воздействие которых направлено исключительно на один или несколько видов белков, которые повреждаются в результате того или иного заболевания. Это область, где наработки, сделанные в течение прошедших двух десятилетий, только начинают приносить первые результаты, открывая перед людьми тайны человеческого генома и позволяя создавать новые методы лечения всевозможных заболеваний начиная от простуды и заканчивая онкологическими заболеваниями.

Эта новая база, доступная сейчас онлайн исследователям во всем мире, и насчитывающая только 1700 записей, является только первым шагом. По мере того, как в ходе различных исследований будут получены данные о новых видах белков, база MoDEL будет постоянно пополняться. По предварительным прогнозам уже через два-три года база MoDEL охватит до 80% всех белков человеческого организма.




Ключевые слова:
База, Данные, MoDEL, Белок, Протеин, Организм, Человек, Заболевание, Protein Data Bank, PDB, Суперкомпьютер, Снимок, Движение

Первоисточник

Другие новости по теме:
  • Ученым впервые удалось идентифицировать белки, являющиеся "смертельным ору ...
  • Использование графена позволило ученым сделать снимки молекул различных бел ...
  • Ученые обнаружили первый в своем роде белок, который "собирает" другие бе ...
  • Компания Google работает над созданием базы, в которой будут содержаться вс ...
  • В Объединенных Арабских Эмиратах создана самая большая в мире база биометри ...




  • 17 ноября 2010 09:00
    #1 Написал: FomaNeverujuwij

    Публикаций: 0
    Комментариев: 3854
    Надеюсь, что это толкнет науку вперед. А вообще, ИМХО, все такие базы должны быть в свободном доступе.


    --------------------
        
    17 ноября 2010 09:52
    #2 Написал: CoJIb

    Публикаций: 0
    Комментариев: 1155
    для умных террористов, что бы вирусы создовали в свободном доступе.
        
    17 ноября 2010 10:56
    #3 Написал: Astronaut

    Публикаций: 2237
    Комментариев: 142
    CoJIb
    и для умных врачей, которые тут же создавали вакцины против вирусов, выращенных террористами wink
        
    17 ноября 2010 21:23
    #4 Написал: CoJIb

    Публикаций: 0
    Комментариев: 1155
    Вирус превращающий людей в зомби, вот веселуха будет am
        
    18 ноября 2010 14:25
    #5 Написал: piligrim

    Публикаций: 0
    Комментариев: 0
    народ а напишите кто-нить адресок этой базы данных
    а то поискал в инете найти не смог, может я криворукий, и чего не правильно искал
    кароч помогите кто может)
        
    18 ноября 2010 14:34
    #6 Написал: admin

    Публикаций: 181
    Комментариев: 113
    piligrim
    Гугль помогает обычно. Нашел за пять секунд PMDB - Protein Model DataBase
        

    Информация

    Посетители, находящиеся в группе Гости, не могут оставлять комментарии к данной публикации.